NOR-WGS: Forbedret infrastruktur for helgenomsekvensering

Prosjektet er organisert i 7 arbeidspakker (Figur 1), hvor hoveddelen av arbeidet vil foregå i arbeidspakkene 5-7.

I arbeidspakke 5 vil vi jobbe med å digitalisere laboratoriearbeidet som gjøres i helgenomsekvenseringen (NGS). Dette inkluderer mottak av elektroniske rekvisisjoner, digitalisering av instrumenter og kobling mot et sentralt datasystem (LIMS), samt elektronisk utsvar av NGS-analysene til rekvirent.

I arbeidspakke 6 vil vi utvikle nye NGS-protokoller og metoder for mikrobielle agens som kan skape alvorlige utbrudd eller sykdom. For å styrke beredskapen ønsker vi også å utvikle NGS-metoder for potensielle nye og ukjente agens.

I arbeidspakke 7 vil vi utvikle verktøy for analyse, visualisering, og deling av NGS-data. Vi vil integrere analyseverktøyene med datasystemet (LIMS) fra arbeidspakke 5 for å få en helhetlig sammenheng mellom prøvemottak, laboratoriet og analyser.